Не смотря на то, что при нахождении недоношенного ребенка в инкубаторе предпринимаются меры по проветриванию и частичной дезинфекции, все же в тех местах, где ее трудно осуществить, могут скапливаться патогенные микробы. В условиях высокой температуры и повышенной влажности, которая присутствует в инкубаторе, происходит их усиленное размножение, что, в конечном итоге, может стать причиной заражения недоношенных детей серьезными заболеваниями. В связи с этим необходимо проводить полную дезинфекцию инкубатора.